据日本共同社报道，由日本自卫队运营的新冠疫苗大规模接种中心的预约系统从１７日开始受理以来接连发现问题。虽然进行了部分修复，但由于不得不在短时间内构筑系统并考虑到个人信息保护，没有和地方政府的系统联网，使用虚假信息也可预约的构造仍未改变。实际情况是依赖于使用者的“善意”。
报道称，预约网站开设后即发现了使用实际不存在的市区町村编号和接种券号码、用不满６５岁的出生年月日也可预约等问题。为配合２４日起的第二轮预约，修改了系统，使输入不存在的市区町村编号或不满６５岁的出生年月日无法办理手续，但接种券号码正确与否仍然无法通过系统判断。
要防止使用虚假或不正确的信息进行预约，确认预约者的市区町村编号、出生年月日是否属实，需要与市区町村掌握的个人信息进行对照，因此系统之间必须联网。
从决定设置中心到受理预约只有短短的约３周时间，日本防卫省放弃了建立复杂的机制。如果与地方政府系统联网，经由防卫省的预约系统，有可能招致大量个人信息被盗的网络攻击，防卫省也重视这一点。
在东京会场的预约系统中，出现了若出生年月日输入错误，返回上一页，手续就无法继续的故障。目前已经修复，但防卫省方面直到媒体指出前都未发现这一问题。
防卫相岸信夫在２８日的记者会上就预约系统称：“被指出了各种问题。我们将认真对待，努力进行修改和完善。”
